Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms