Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms