Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtlP38585 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtlP38585 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TtlP38585 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TtlP38585 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TtlP38585 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TtlP38585 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TtlP38585 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtlP38585 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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TtlP38585 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtlP38585 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtlP38585 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtlP38585 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtlP38585 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtlP38585 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtlP38585 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtlP38585 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtlP38585 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtlP38585 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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TtlP38585 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtlP38585 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtlP38585 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms