Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PpardP35396 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpardP35396 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpardP35396 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpardP35396 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpardP35396 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpardP35396 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpardP35396 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpardP35396 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpardP35396 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpardP35396 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpardP35396 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpardP35396 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpardP35396 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpardP35396 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpardP35396 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpardP35396 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpardP35396 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpardP35396 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpardP35396 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpardP35396 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PpardP35396 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PpardP35396 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PpardP35396 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PpardP35396 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpardP35396 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpardP35396 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpardP35396 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpardP35396 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpardP35396 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpardP35396 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpardP35396 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpardP35396 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpardP35396 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpardP35396 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpardP35396 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpardP35396 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms