Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab20P35295 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms