Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Nedd1P33215 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms