Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms