Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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