Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msr1P30204 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msr1P30204 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms