Protein–RNA interactions for Protein: P29121

Pcsk4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk4P29121 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk4P29121 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk4P29121 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pcsk4P29121 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk4P29121 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pcsk4P29121 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pcsk4P29121 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk4P29121 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pcsk4P29121 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk4P29121 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pcsk4P29121 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk4P29121 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pcsk4P29121 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk4P29121 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pcsk4P29121 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk4P29121 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk4P29121 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk4P29121 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk4P29121 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk4P29121 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pcsk4P29121 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pcsk4P29121 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pcsk4P29121 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pcsk4P29121 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pcsk4P29121 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pcsk4P29121 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pcsk4P29121 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk4P29121 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pcsk4P29121 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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