Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms