Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GrnP28798 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GrnP28798 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GrnP28798 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GrnP28798 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GrnP28798 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GrnP28798 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GrnP28798 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GrnP28798 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms