Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd10P28359 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms