Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Etv4P28322 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms