Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb1P28230 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms