Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjc1P28229 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjc1P28229 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms