Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Xrcc5P27641 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Xrcc5P27641 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Xrcc5P27641 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms