Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms