Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms