Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd1P25322 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms