Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd247P24161 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd247P24161 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms