Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gria1P23818 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms