Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd12P23812 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms