Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms