Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PparaP23204 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PparaP23204 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PparaP23204 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PparaP23204 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PparaP23204 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PparaP23204 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PparaP23204 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PparaP23204 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PparaP23204 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PparaP23204 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PparaP23204 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PparaP23204 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PparaP23204 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PparaP23204 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PparaP23204 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PparaP23204 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PparaP23204 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PparaP23204 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PparaP23204 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PparaP23204 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PparaP23204 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PparaP23204 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PparaP23204 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PparaP23204 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PparaP23204 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PparaP23204 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PparaP23204 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PparaP23204 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms