Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx3P23198 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx3P23198 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx3P23198 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms