Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RarbP22605 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RarbP22605 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RarbP22605 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RarbP22605 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RarbP22605 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RarbP22605 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RarbP22605 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RarbP22605 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RarbP22605 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RarbP22605 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RarbP22605 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RarbP22605 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RarbP22605 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RarbP22605 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RarbP22605 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RarbP22605 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RarbP22605 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RarbP22605 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RarbP22605 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RarbP22605 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RarbP22605 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RarbP22605 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RarbP22605 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RarbP22605 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RarbP22605 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RarbP22605 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RarbP22605 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RarbP22605 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RarbP22605 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RarbP22605 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RarbP22605 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RarbP22605 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RarbP22605 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RarbP22605 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RarbP22605 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RarbP22605 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RarbP22605 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RarbP22605 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RarbP22605 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms