Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms