Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou5f1P20263 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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