Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms