Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NefhP19246 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NefhP19246 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NefhP19246 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NefhP19246 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NefhP19246 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NefhP19246 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NefhP19246 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NefhP19246 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NefhP19246 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NefhP19246 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NefhP19246 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NefhP19246 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NefhP19246 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NefhP19246 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NefhP19246 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NefhP19246 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NefhP19246 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NefhP19246 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NefhP19246 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NefhP19246 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NefhP19246 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NefhP19246 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NefhP19246 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NefhP19246 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NefhP19246 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NefhP19246 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NefhP19246 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NefhP19246 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NefhP19246 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NefhP19246 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NefhP19246 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NefhP19246 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NefhP19246 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms