Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms