Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RargP18911 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RargP18911 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RargP18911 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RargP18911 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RargP18911 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RargP18911 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RargP18911 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms