Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18524 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18524 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18524 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P18524 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18524 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18524 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18524 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18524 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18524 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18524 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18524 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18524 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18524 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18524 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18524 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18524 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18524 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18524 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P18524 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18524 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18524 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18524 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18524 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18524 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18524 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18524 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18524 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18524 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18524 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18524 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18524 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18524 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P18524 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18524 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18524 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms