Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpraP18052 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpraP18052 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpraP18052 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms