Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hoxb1P17919 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hoxb1P17919 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hoxb1P17919 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hoxb1P17919 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hoxb1P17919 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb1P17919 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms