Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Selenbp1P17563 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Selenbp1P17563 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Selenbp1P17563 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Selenbp1P17563 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms