Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms