Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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