Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ass1P16460 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ass1P16460 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ass1P16460 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ass1P16460 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms