Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf271P15620 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf271P15620 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms