Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd44P15379 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms