Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd5P13379 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd5P13379 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd5P13379 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms