Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms