Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms