Protein–RNA interactions for Protein: P12025

Mdk, Midkine, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MdkP12025 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MdkP12025 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MdkP12025 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MdkP12025 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MdkP12025 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MdkP12025 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MdkP12025 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MdkP12025 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MdkP12025 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MdkP12025 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MdkP12025 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MdkP12025 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms