Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga5P11688 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga5P11688 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga5P11688 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms