Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp28P10078 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms