Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb2P0C1T1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb2P0C1T1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxb2P0C1T1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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