Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa9P09631 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa9P09631 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa9P09631 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa9P09631 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa9P09631 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa9P09631 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa9P09631 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms